Die Akademie gehört folgenden Dachverbänden und Netzwerken an:
Gesellschaft der Europäischen Akademien
Gesellschaft der Europäischen Akademien
mit siebzehn Europahäusern und Europäischen Akademien
in der Bundesrepublik Deutschland.
AdB
Arbeitskreis deutscher Bildungsstätten (AdB),
der über 100 Einrichtungen der politischen Jugend- und Erwachsenenbildung umfasst.
Netzwerk "Politische Bildung in der Bundeswehr" der Bundeszentrale für politische Bildung
und arbeitet zusammen mit dem
IEP
Institut für Europäische Politik (IEP),
das insbesondere wissenschaftliche Grundlagen für die europäische Bildungsarbeit erstellt.
Die Europäische Akademie Bayern erhält eine institutionelle Förderung aus dem Haushalt des Bayerischen Staatsministeriums für Unterricht und Kultus.
Für den Projektbereich und ausschließlich zur Finanzierung von Seminaren erhält die Akademie Projektmittel von folgenden Landes-, Bundes- und internationalen Organisationen:
- Bayerische Landeszentrale für politische Bildungsarbeit
- Bundesministerium für wirtschaftliche Zusammenarbeit und Entwicklung
- Bundeszentrale für politische Bildung
- Deutscher Bundestag
- Deutsch-Französisches Jugendwerk
- Europäische Kommission
- Europäisches Parlament
- Presse- und Informationsamt der Bundesregierung
- UNESCO